środa, 7 grudnia 2022

Badanie sugeruje, że próbki śliny mogą być lepszymi wskaźnikami trwałości SARS-CoV-2 niż wymazy z nosa

W najnowszym badaniu opublikowanym w czasopiśmie PLOS ONE naukowcy z Rutgers New Jersey Medical School badali trwałość koronawirusa 2 (SARS-CoV-2) zespołu ostrej niewydolności oddechowej w ludzkiej ślinie. Dokładna i szybka diagnostyka zakażenia SARS-CoV-2 okazała się krytyczna w zarządzaniu chorobą koronawirusową 2019 (COVID-19). Wymazy ze śliny i wymazy z nosa są niektórymi popularnie stosowanymi nieinwazyjnymi metodami badania zakażenia przy minimalnym lub żadnym nadzorze, umożliwiając tym samym powszechną działalność w zakresie badania COVID-19. W kilku badaniach przeprowadzonych na próbkach z nosa i gardła odnotowano zmniejszenie wydalania wirusa wraz ze spadkiem ilości wirusa nadającego się do hodowli w ciągu pierwszego tygodnia od wystąpienia objawów COVID-19. Jednak tylko kilka badań oceniało czas, przez jaki SARS-CoV-2 jest wykrywany w próbkach śliny w porównaniu do wymazów z nosa po pierwszym tygodniu objawów. W obecnym badaniu naukowcy sprawdzali, czy badanie śliny wykrywa przedłużoną obecność SARS-CoV-2 i związaną z tym potencjalną zakaźność. Zespół porównał dynamikę wiremii związaną z próbkami ślinowymi i nosowymi, wykonując badanie cząstkowe w ramach obserwacyjnego badania grupowego technik terapeutycznych i diagnostycznych wśród pacjentów COVID-19. Kwalifikowanymi uczestnikami byli pacjenci, którzy zostali zapisani do Szpitala Uniwersyteckiego w New Jersey. Uczestnicy ci byli w wieku 18 lat lub starsi i testowali SARS-CoV-2-dodatni przez wymaz z nosogardła (NP) i wyrazili zgodę na dostarczenie próbek nosa i śliny. Uczestnicy, którzy mieli być leczeni na COVID-19 w trakcie hospitalizacji, byli monitorowani. Do badania cząstkowego włączono wszystkich uczestników badania macierzystego, którzy dostarczyli znany czas trwania od wystąpienia objawów oraz próbkę nosa i śliny dla co najmniej jednego punktu czasowego badania. Wszyscy kwalifikujący się uczestnicy byli częścią ogólnej oceny, która obejmowała sparowaną analizę śliny i wymazu z nosa, odniesioną do czasu wystąpienia objawów COVID-19. W badaniu zebrano próbki takie jak ślina, wymazy z nosa przedniego i wymazy z NP. Od czerwca 2020 do sierpnia 2021 roku do badania zrekrutowano łącznie 140 uczestników, spośród których wykluczono 44 osoby. Wśród pozostałych 96 pacjentów, około 147 wymazów z nosa i śliny zostało ocenionych jako sparowane obserwacje w całym badaniu. Spośród tych 96 uczestników z ogólnej grupy analitycznej, 28 uczestników mających ponad jednorazowe zbieranie punktów kwalifikowało się do analizy podłużnej. Wśród 96 uczestników z ogólnej grupy analitycznej, średni wiek pacjenta wynosił 54,7 lat, w tym 53% mężczyzn i 55% Latynosów. Średnie pobranie próbki podstawowej nastąpiło siedem dni po wystąpieniu objawów. Większość uczestników zgłaszała co najmniej jedną chorobę współistniejącą, taką jak otyłość lub nadciśnienie, była narażona na kontakt z inną osobą mającą objawy SARS-CoV-2 lub wymagała dodatkowego tlenu podczas pobytu w szpitalu. Ważnymi przedziałami czasowymi w badaniu były ponad pięć dni, reprezentujące najmniej zalecany okres izolacji dla SARS-CoV-2, oraz ponad dziewięć dni, kiedy to uznano, że pacjenci nie są już zakaźni SARS-CoV-2 ze względu na brak dającego się hodować wirusa w próbkach z nosa lub NP. Zespół zauważył, że duszność była bardziej powszechna w kohortach od pięciu do dziewięciu dni i 10-14 dni przerwy, podczas gdy wszystkie inne objawy były porównywalne między kohortami. Pacjenci częściej potrzebowali wsparcia tlenowego w późniejszych okresach niż pacjenci we wcześniejszych okresach. Ponadto uczestnicy, którzy zostali zrekrutowani w okresie krótszym niż pięć dni od wystąpienia objawów, mieli większe prawdopodobieństwo, że są czarnoskórzy, palący i mieli większą częstość występowania przewlekłej choroby nerek. Ogólna ocena wykazała, że badanie śliny wykryło znacznie więcej zakażeń SARS-CoV-2 w ciągu pięciu dni, po pięciu dniach, po dziewięciu dniach i po 14 dniach od wystąpienia objawów SARS-CoV-2. Ponadto stwierdzono, że ogólna mediana wartości Ct celu N2 jest wcześniejsza w przypadku próbek ślinowych niż nosowych. Również wartości Ct były wcześniejsze dla próbek ślinowych niż nosowych dla wszystkich okresów czasu, w tym po 14 dniach od wystąpienia objawów. Wskaźniki pozytywnego wyniku badania SARS-CoV-2 po pięciu dniach od wystąpienia objawów były porównywalne pomiędzy próbkami śliny i wymazów z nosa. Również ogólne wartości Ct nie różniły się znacząco pomiędzy wymazami z NP na podłożu do transportu wirusów (VTM) a bezpośrednimi próbkami śliny. Dodatkowo, nie odnotowano różnic w medianie wartości Ct lub w liczbie testów, które dały wartości Ct poniżej 30, pomiędzy próbkami śliny i wymazami NP dla wszystkich ocenianych okresów czasu. Wyniki badania podkreśliły dowody na wykrywanie przedłużonej obecności SARS-CoV-2 w próbkach śliny w porównaniu z próbkami z nosa po początkowym tygodniu od wystąpienia objawów, w tym rozprzestrzeniania się wirusa. Badacze uważają, że wyniki te wspierają włączenie badania śliny w późniejszych okresach przebiegu choroby w celu poprawy wydajności diagnozy SARS-CoV-2 oraz potencjał przedłużonego czasu infekcji w jamie ustnej w umożliwieniu wykrycia oceny na podstawie śliny u osób z rozpoznaniem COVID-19.