piątek, 9 grudnia 2022

Badanie dostarcza informacji na temat stabilności SARS-CoV-2 w płynach biologicznych zwierząt

W najnowszym badaniu opublikowanym w czasopiśmie Viruses naukowcy ocenili stabilność koronawirusa 2 ciężkiego ostrego zespołu oddechowego (SARS-CoV-2) wśród płynów biologicznych znalezionych u zwierząt. Od momentu pojawienia się SARS-CoV-2 w 2019 r., wirus stale ewoluował genetycznie, przeskakiwał bariery gatunkowe i dalej rozszerzał swój zakres gospodarzy. Ponadto ostatnie badania wykryły transmisję międzygatunkową, taką jak zakażenie zwierząt domowych, a także krążenie wirusa wśród dzikich zwierząt. Jednak zrozumienie stabilności SARS-CoV-2 w płynach biologicznych zwierząt i ich funkcji w przenoszeniu wirusa jest ograniczone, ponieważ wcześniejsze badania dotyczyły głównie płynów biologicznych ludzi. W obecnym badaniu naukowcy z Uniwersytetu Stanowego Kansas określili stabilność SARS-CoV-2 w płynach biologicznych uzyskanych od trzech gatunków zwierząt, mianowicie owiec, kotów i jeleni białych (WTD). Zespół pobrał próbki śliny, kału i moczu od owiec, kotów i WTD. Wpływ cytopatyczny oceniano cztery dni po inokulacji SARS-CoV-2, a następnie oceniano miano wirusa. Stabilność wykazywaną przez SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs) badano w zawiesinach kału WTD przy użyciu SARS-CoV-2 Alpha, Delta i Omicron VOCs, które hodowano w komórkach Vero-transmembranowej proteazy serynowej 2 (TMPRSS2). Każdy zapas wirusa został również poddany sekwencjonowaniu. Szczep WA-1 był hodowany w komórkach Vero-TMPRSS2, aby stworzyć inokulę wirusa w porównywalnych warunkach. Zespół oszacował tempo rozpadu wirusa SARS-CoV-2 poprzez zbadanie, czy powiązane próbki były pozytywne pod względem wirusa w co najmniej dwóch punktach czasowych. Wyniki badania wykazały, że po inkubacji SARS-CoV-2 w płynach biologicznych kotów, zespół odnotował niski poziom zakaźnego wirusa pomiędzy 100,767 a 101,633 TCID50 wyizolowanego do jednego dnia po skażeniu (dpc) w połączonych próbkach śliny kotów, niezależnie od warunków środowiskowych. W zbiorczych próbkach kału kotów również stwierdzono miano wirusa pomiędzy 100,767 a 102,412 TCID50 w godzinę po skażeniu (hpc), podczas gdy zakaźnego wirusa nie można było wykryć do 7 hpc. W zbiorczej zawiesinie kału kotów 10%, SARS-CoV-2 przetrwał do jednego dnia w środowisku zimowym i w pomieszczeniach zamkniętych, z wartościami okresu półtrwania wynoszącymi odpowiednio 9,16 godzin i 5,99 godzin. Z drugiej strony, zespół odnotował dłuższe przeżycie wirusa w próbkach moczu kotów. Ponadto, w odniesieniu do warunków jesiennych i wiosennych, SARS-CoV-2 wykazywał stabilność przez okres do trzech do siedmiu dni w połączeniu z dwoma pojedynczymi próbkami moczu kotów. Warto zauważyć, że wartości okresu półtrwania obserwowane w warunkach zimowych były znacznie krótsze w porównaniu z warunkami jesiennymi lub wiosennymi dla wszystkich trzech testów próbek moczu kotów. Inkubacja wirusa w płynach biologicznych owiec wykazała, że miano wirusa 102,301 TCID50 zostało odzyskane przy 1 hpc w połączonych próbkach śliny owiec w środowisku wewnętrznym, podczas gdy w warunkach letnich nie wykryto żadnego wirusa. Ponadto, SARS-CoV-2 wykazywał stabilność do 1 dpc w zebranych próbkach śliny owiec, biorąc pod uwagę środowisko wiosenne/jesienne i zimowe, z wartościami okresu półtrwania wynoszącymi odpowiednio 9,04 godziny i 7,34 godziny. Zespół nie odzyskał jednak żadnego zakaźnego wirusa z połączonych próbek kału owiec lub 10% zawiesiny kału w żadnym z badanych punktów czasowych. Inkubacja wirusa w płynach biologicznych WTD wykazała, że SARS-CoV-2 przetrwał przez 1 dpc w próbkach śliny zebranych w WTD, ujawniając wartości okresu półtrwania 1,23 godziny dla środowiska wewnętrznego, 1,08 godziny dla środowiska letniego i 4,52 godziny dla środowiska zimowego. SARS-CoV-2 wykazywał dużą stabilność do 6 dpc w połączonych próbkach kału WTD, wykazując okres półtrwania 6,28 godzin w środowisku wewnętrznym, 6 godzin w środowisku jesienno-wiosennym i 24,44 godzin w środowisku zimowym. Wynik ten był w oczywistym kontraście z wynikami dla próbek kału owiec, kotów i ludzi. SARS-CoV-2 wykazywał również stabilność w zbiorczych próbkach moczu WTD do 21 dpc i ujawnił sezonowy trend stabilności. Z drugiej strony, próbka moczu jednego z WTD, która została uzyskana z pęcherza moczowego podczas nekroskopii wykazała, że SARS-CoV-2 był stabilny tylko do 7 hpc w środowisku letnim i w pomieszczeniach zamkniętych oraz 1 dpc w środowisku zimowym i jesienno-wiosennym. Wskazało to na zróżnicowane tempo rozpadu wirusa w próbkach moczu uzyskanych od tego samego uczestnika przy zastosowaniu różnych technik. Wyniki badań wykazały, że SARS-CoV-2 mógł przetrwać do jednego dnia po inokulacji w próbkach śliny owiec, kotów i WTD. Zespół mógł izolować wirusa do sześciu dni w próbkach kału WTD i do 15 dni w zawiesinach kału WTD. Jednak wirus był stosunkowo niestabilny w próbkach kału owiec i samochodów oraz w zawiesinach kału. Chociaż dokładna funkcja biologicznych wydalin i wydzielin w transmisji wirusów jest niejasna, naukowcy uważają, że badanie zapewniło nowy wgląd w ich rolę w transmisji SARS-CoV-2.