sobota, 18 lutego 2023

Wykorzystanie sygnatury genu do przewidywania odpowiedzi pacjenta na raka na środek chemioterapeutyczny cisplatynę

Naukowcy z Cleveland Clinic zrobili ważny krok w przewidywaniu, jakie leczenie będzie skuteczne u poszczególnych pacjentów z rakiem. Wykorzystując sygnaturę genów opracowaną na podstawie linii komórkowych i tkanek ludzkich, zespół badawczy wykazał zdolność do przewidywania odpowiedzi pacjenta na środek chemioterapeutyczny cisplatynę, bez polegania na zmianach w statusie mutacyjnym nowotworu pacjenta. Badanie zostało niedawno opublikowane w NPJ Precision Oncology. W ostatnich latach pojawiły się nowe, skuteczne metody leczenia raka, które przedłużają życie pacjentów z celowanymi mutacjami genów. Jednak szacuje się, że tylko 7% pacjentów z rakiem ma mutację genetyczną, która jest możliwa do ukierunkowania. To nowe zrozumienie mogłoby pomóc wielu pacjentom uniknąć toksyczności związanych z chemioterapią i przejść do opcji, która ma większe szanse na skuteczność. Obecnie, jeśli spojrzeć na poziom populacyjny, wiemy, że pewien odsetek pacjentów odpowie na daną chemioterapię, ale chcemy wiedzieć 'która z nich zadziała u pacjenta, który stoi przede mną'?" Jacob G. Scott, M.D., D.Phil., współkorespondujący autor badania i kierownik Laboratorium Podziału Teorii, Department of Translational Hematology and Oncology Research, Cleveland Clinic Naukowcy od lat pracują nad wykorzystaniem sygnatur genowych do medycyny predykcyjnej, ale trudno było zinterpretować, jak konkretne sygnatury genowe działałyby w ludzkim organizmie. W tym badaniu zespół stara się pokonać tę przeszkodę poprzez włączenie próbek guzów do metod ekstrakcji. Sygnatura odpowiedzi na cisplatynę, CisSig, została wykazana w celu przewidywania odpowiedzi na cisplatynę w liniach komórkowych. Używając nowej metody ekstrakcji sygnatur, badacze stworzyli CisSig, aby przewidzieć, jak dobrze na terapię zareagują pacjenci z guzami pochodzącymi z komórek nabłonkowych. Dzięki tej informacji uzyskali wynik pozwalający określić, jak dobrze dana osoba odpowie na cisplatynę. Chociaż cisplatyna jest stosowana jako lek pierwszego rzutu w przypadku wielu nowotworów, jest również jednym z najstarszych środków chemioterapii. "Jeśli możemy pomóc pacjentowi uniknąć leku, na który nie zareaguje, i przejść do środka drugiego rzutu, z którego najprawdopodobniej skorzysta, ma to duży wpływ" - powiedziała Jessica A. Scarborough, Ph.D., główna autorka badania i stypendystka w Department of Translational Hematology and Oncology Research w Cleveland Clinic. Naukowcy przeprowadzili wstępną walidację swojego podejścia u pacjentów z mięśniowo-inwazyjnym rakiem pęcherza moczowego. Wykorzystując dwie kohorty próbek guzów przed leczeniem, wykazali, że CisSig był predyktorem odpowiedzi terapeutycznej na cisplatynę. W celu dalszej walidacji swojego podejścia, zespół badawczy planuje rozbudować tę pracę o badania retrospektywne na większą skalę. Wykorzystując tkanki z Cleveland Clinic Biobank, sekwencjonują sygnatury genów pacjentów z rakiem pęcherza moczowego oraz głowy i szyi leczonych cisplatyną. Ponadto zespół prowadzi sponsorowane przez NIH badanie mające na celu prospektywne przetestowanie tego wyniku zarówno w raku pęcherza moczowego, jak i głowy i szyi.